Um dos mais recentes espaços para a prática do culto católico em Portimão, a Igreja da N. Senhora do Amparo tem a sua origem na obra paroquial começada pelo Pe. Arsénio Castro Silva em 1976, com a criação de uma comunidade de jesuítas em 1976, inicialmente junto do Bairro Operário, passando pouco depois para um terreno cedido pela Câmara Municipal na urbanização então em curso da Quinta do Amparo, num lote onde já se encontrava uma pequena capela de planta retangular remontando aos tempos em que aquela era uma grande propriedade às portas do núcleo urbano de Portimão.

Fruto de um trabalho de comunal, a Igreja foi sendo paulatinamente edificada, sendo inaugurada em 1990.